成果名称：WSSV病毒microRNA对对虾细胞自噬的影响研究
研发人员：吴文林
所属领域：生物医学
完成单位：金算盘49819更新
项目简介：
1 建立了对虾自噬研究模型。
2 获得了对虾自噬诱导后基因表达变化的数据库。采用对虾转录组测序分析，提取对照组和自噬诱导组对虾的RNA，分析自噬诱导条件下对虾基因转录变化。结果发现了3050个基因的表达出现变化，其中自噬诱导条件下1456个基因表达上调，1594个基因表达下调。通过差异表达基因的聚类分析、GO功能富集、KEGG注释、KEGG通路富集分析等手段，分析这些差异表达基因与细胞代谢、环境应激等过程的关系，为找到对虾自噬相关基因及其cDNA序列奠定了良好基础。
3 获得了WSSV感染后对虾miRNA的表达谱并发现和鉴定了新的miRNA分子。对WSSV感染对虾和健康对虾的miRNA测序结果进行分析，共预测出59 个miRNA，其中已知miRNA 5 个，新预测miRNA 54 个。对这59个microRNA的表达谱的分析发现，当对虾被WSSV感染后，有8个miRNA的表达上调。
4 获得了52个来源于WSSV的miRNA分子及其序列。对这52个miRNA的功能开展研究，分析其与细胞自噬作用的关系，有利于揭示WSSV感染对细胞自噬的影响，促进我们对WSSV病毒感染机制的了解。